iPhone SE ble testet under kontrollerte laboratorieforhold og har, i henhold til IEC-standard 60529, en sprut-, vann- og støvbestandighetrangering på IP67 (maksimal dybde på 1 meter i opptil 30 minutter). Sprut-, vann- og støvbestandighet er ikke permanente tilstander. Bestandigheten kan svekkes som følge av normal slitasje. Ikke lad en våt iPhone. I brukerhåndboken er det beskrevet hvordan du rengjør og tørker den. Garantien dekker ikke skader forårsaket av væske.
Testene ble utført av Apple i januar 2022 med førproduksjonsenheter av iPhone SE (3. gen.) og førlanseringsprogramvare samt tilbehøret Apple USB‑C-lader (20-watts modell A2305). Tester av hurtiglading ble utført med utladede iPhoner. Ladetiden avhenger av innstillingene og omgivelsene. Faktiske resultater varierer.